Clustering con PVM

Intro

Questa e' la traccia della guida che scrivero'

Installazione PVM

• Installare pvm e pvm-dev

root@insanelab-cluster:apt-get install pvm
root@insanelab-cluster:apt-get install pvm-dev

• modificare /etc/profile aggiungendo:
  

#variable for PVM
PVM_ROOT=/usr/lib/pvm3
export PVM_ROOT

PVM_ARCH=`$PVM_ROOT/lib/pvmgetarch`
export PVM_ARCH

PVM_RSH=/usr/bin/ssh
export PVM_RSH

PVM_TMP=/tmp
export PVM_TMP

#Add pvm binary to PATH
PATH=$PVM_ROOT/bin:$PATH
export PATH

• Modificare il file LINUX.def inserendo il modo che usiamo per connetterci (ssh)

nano /usr/lib/pvm3/conf/LINUX.def

#LINUX.def
ARCHCFLAGS      =       -DSYSVSIGNAL -DNOWAIT3 -DRSHCOMMAND=\"/usr/bin/ssh\" \
                               -DNEEDENDIAN -DFDSETNOTSTRUCT -DHASERRORVARS \
                               -DCTIMEISTIMET -DSYSERRISCONST

Configurazione sistema

• Editare /etc/hosts commentatando localhost e aggiungendo i nodi

#/etc/hosts 
#127.0.0.1      localhost.localdomain   localhost       insanelab-cluster
 192.168.100.69 insanelab-cluster
 192.168.100.3  node3
 192.168.100.5  node5
 192.168.100.2  node2

• Creare un utente per ogni nodo

root@nodeX:adduser user

Evitare la password con ssh

• Bisogna generare una chiave nel server (edalab-cluster)

user@insanelab-cluster: ssh-keygen -t rsa

• entrare nella directory /home/user/.ssh/

user@insanelab-cluster: cd /home/user/.ssh

• copiare id_rsa.key in tutti i nodi

user@insanelab-cluster: scp id_rsa user@nodeX://home/user/.ssh

• Loggarsi nei nodi

ssh user@nodeX

• Entrare nella directory .ssh e copiare la chiave in authorizedkey2

cd .ssh
cat id_rsa.key >> authorizedkey2
rm id_rsa.key

• Riavviare ssh ed e' fatta!